La fin de l'année 2022 est marquée par le risque imminent d'une nouvelle variante de coronavirus, avertissent les experts de la santé
Des sous-variantes de la variante Omicron du coronavirus continuent de circuler dans le monde, et "nous voyons Omicron faire ce que font les virus, c'est-à-dire acquérir des mutations en cours de route qui l'aident à échapper à un peu d'immunité induite par une infection ou une vaccination antérieure", a déclaré Andrew Pekosz, microbiologiste et immunologiste à l'École de santé publique Johns Hopkins Bloomberg, à Baltimore.
"Nous n'avons pas vu de grands changements en termes d'évolution d'Omicron depuis un certain temps", a-t-il ajouté. Mais "nous arrivons à un stade où nous devons continuer à surveiller la situation".
Aux États-Unis, les sous-variantes Omicron XBB.1.5, BQ.1.1, BQ.1, BA.5 et XBB sont à l'origine de la quasi-totalité des infections à Covid-19, selon les données des Centres américains de contrôle et de prévention des maladies (CDC).
Pour cette semaine, les CDC estiment que le XBB.1.5 est désormais à l'origine de 40,5 % des cas aux États-Unis, suivi du BQ.1.1 (26,9 %), du BQ.1 (18,3 %), du BA.5 (3,7 %) et du XBB (3,6 %).
"Le SARS-CoV-2, le virus qui cause le COVID-19, change constamment et accumule des mutations dans son code génétique au fil du temps. De nouvelles variantes du SARS-CoV-2 devraient continuer à émerger", écrivent les chercheurs des CDC dans leur outil de suivi des données. "Certaines variantes apparaîtront et disparaîtront, tandis que d'autres apparaîtront et continueront à se propager et pourront remplacer les variantes précédentes.
Les ramifications d'Omicron semblent également dominer au niveau mondial, mais comme le coronavirus continue de se propager - en particulier en Chine après l'assouplissement rapide des restrictions par Pékin - on s'inquiète désormais de la direction que pourraient prendre les tendances du Covid-19 en 2023 et du risque d'émergence de nouvelles variantes.
"William Schaffner, professeur à la division des maladies infectieuses du centre médical de l'université Vanderbilt à Nashville et directeur médical de la Fondation nationale pour les maladies infectieuses. "C'est ce qui a conduit les CDC à annoncer très récemment qu'ils allaient obliger les personnes venant de Chine à subir un test de dépistage et à obtenir un résultat négatif avant de pouvoir entrer dans le pays.
Les autorités sanitaires américaines ont annoncé mercredi qu'à partir du 5 janvier, les voyageurs en provenance de Chine devront présenter un résultat négatif au test Covid-19 avant de prendre l'avion pour les États-Unis. Les passagers en provenance de Chine et se rendant aux États-Unis devront se soumettre à un test au plus tard deux jours avant leur départ et présenter la preuve de leur résultat négatif à leur compagnie aérienne avant l'embarquement.
Les autorités ont également annoncé que le CDC étendait le programme de surveillance génomique des voyageurs aux aéroports de Seattle et de Los Angeles, ce qui porte à sept le nombre total d'aéroports participants. Environ 500 vols hebdomadaires en provenance d'au moins 30 pays sont couverts, dont environ 290 vols hebdomadaires en provenance de Chine et des régions avoisinantes.
Le gouvernement chinois n'a pas communiqué beaucoup d'informations sur la composition génétique des virus qu'il observe dans ce pays, a indiqué M. Schaffner.
"C'est parce que le gouvernement chinois ne le faisait pas que le CDC a mis en place cette nouvelle obligation de voyager. Il ne s'agit certainement pas d'empêcher la simple transmission du Covid depuis la Chine. Nous avons beaucoup de Covid. Cela reviendrait à dire aux gens de ne pas verser un seau d'eau dans une piscine", a-t-il déclaré. "L'obligation de tester les déplacements est un moyen de gagner du temps et de créer une sorte de tampon entre nous et la Chine, au cas où une nouvelle variante apparaîtrait soudainement dans ce pays.
Il a ajouté que les États-Unis auraient besoin "d'autant de temps que possible" pour mettre à jour les vaccins et les antiviraux afin de répondre à une éventuelle variante émergente préoccupante.
C'est vraiment un trou noir
Les exigences américaines en matière de tests pour les voyageurs permettront de "gagner du temps", mais elles n'empêcheront pas l'arrivée de nouveaux cas de Covid-19 aux États-Unis ni l'émergence de nouvelles variantes, a déclaré le Dr Carlos Del Rio, doyen associé de l'Emory School of Medicine et du Grady Health System d'Atlanta.
"Honnêtement, je ne pense pas que nous verrons beaucoup d'avantages", a-t-il déclaré à propos des exigences en matière de voyage. "La chose la plus importante dont nous avons besoin en ce moment, c'est que les Chinois fassent preuve de plus de transparence et nous disent exactement ce qui se passe, et il s'agit là d'une décision diplomatique. C'est une question de diplomatie.
En ce qui concerne les données génétiques sur les coronavirus en Chine qui sont accessibles au public, "c'est vraiment un trou noir", a déclaré M. Pekosz. Près de 250 millions de personnes en Chine pourraient avoir attrapé le Covid-19 au cours des 20 premiers jours de décembre, selon une estimation interne des plus hauts responsables de la santé du pays, ont rapporté Bloomberg News et le Financial Times la semaine dernière.
"Pour moi, ce qui est vraiment préoccupant, ce sont les infections en cours et la question de savoir s'ils produisent d'autres variantes en Chine qui pourraient être particulièrement inquiétantes pour nous, et tester les gens avant qu'ils ne prennent l'avion ne répondra pas à cette question", a déclaré M. Pekosz.
"Ce dont nous avons vraiment besoin, c'est de faire un bien meilleur travail de séquençage des virus des personnes qui voyagent depuis la Chine, afin de pouvoir mieux comprendre quels types de variantes circulent dans ce pays", a-t-il ajouté, précisant que tout au long de la pandémie, les autorités chinoises n'ont pas été très transparentes en ce qui concerne leurs données sur les variantes.
Plus de propagation, plus de variantes
La propagation constante d'un virus peut conduire à l'émergence de variantes. Plus un virus se propage, plus il mute.
"Pour qu'une variante émerge - et c'est vrai non seulement pour Covid, mais aussi pour la grippe et pour beaucoup d'autres virus -, le plus important est que plus il y a de cas, plus il est probable que le virus commence à accumuler des mutations qui pourraient lui permettre d'échapper plus efficacement à l'immunité ou de se transmettre plus efficacement", a déclaré M. Pekosz.
"Ainsi, dans une situation comme celle que l'on commence à observer en Chine, où l'on compte des millions et des millions d'infections, chacune de ces infections est une occasion supplémentaire pour le virus d'acquérir une mutation aléatoire qui pourrait lui permettre de mieux infecter les gens", a-t-il ajouté. "Si l'on ajoute à cela le fait que la population chinoise a utilisé des vaccins moins qu'optimaux et qu'elle n'a apparemment pas été aussi efficace que d'autres pays pour administrer des rappels, cela signifie que le niveau d'immunité de la population est probablement plus faible.
Les autorités sanitaires chinoises ont "sensiblement augmenté" le nombre de séquences génomiques de coronavirus et d'autres données connexes qu'elles soumettent à la base de données mondiale GISAID, une initiative qui gère des bases de données permettant aux scientifiques du monde entier de partager des données sur les virus de la grippe et les coronavirus.
Mais de nombreux experts estiment que ce n'est pas suffisant.
Dans un courriel adressé à CNN mercredi, la GISAID a indiqué que le Centre chinois de contrôle et de prévention des maladies et plusieurs centres régionaux du pays "ont sensiblement augmenté le nombre de soumissions de séquences génomiques et de métadonnées associées provenant d'échantillons prélevés au cours des derniers jours".
Selon la GISAID, le nombre de séquences génomiques en provenance de Chine s'élevait à un peu moins de 1 000 vendredi.
La GISAID a également confirmé que les séquences provenant de Chine "ressemblent toutes étroitement à des variantes connues circulant dans le monde entier et observées dans différentes parties du monde entre juillet et décembre 2022", par rapport aux 14,4 millions de génomes de sa base de données.
"Ces dernières données donnent un aperçu de l'évolution des variantes Omicron et montrent que les séquences les plus récemment partagées en Chine sont étroitement liées à des variantes qui circulent depuis un certain temps", selon la GISAID.
Ce que l'avenir nous réserve
Le Covid-19 est actuellement dans un état relativement "stable" aux États-Unis, mais le pays enregistre encore environ 350 décès liés à la maladie chaque jour, a déclaré le Dr Jessica Justman, professeur agrégé de médecine en épidémiologie à la Mailman School of Public Health de l'université de Columbia et directrice technique principale du programme de santé mondiale ICAP.
Bien que les niveaux de Covid-19 restent bien inférieurs à ceux des vagues précédentes, les tendances sont à la hausse dans certaines régions des États-Unis, les nouvelles admissions à l'hôpital ont fait un bond de près de 50 % au cours du mois dernier, et l'on craint de plus en plus que le nombre de cas ne grimpe en flèche après les vacances d'hiver.
Pour réduire le risque d'une propagation accrue du Covid-19, M. Justman a déclaré qu'il serait important, au cours de la nouvelle année, que les gens restent à jour dans leurs vaccinations contre le Covid-19.
Selon les données du CDC, seulement 14,6 % de la population américaine âgée de 5 ans et plus a reçu son vaccin de rappel mis à jour.
"Alors, où allons-nous ? Cela m'amène en Chine", a déclaré Justman.
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"Je crains que la Chine ne soit actuellement un gigantesque incubateur de SRAS-CoV-2. Il est possible d'avoir un grand nombre d'infections et, par conséquent, de nouvelles variantes", a-t-elle déclaré.
"Je pense qu'en 2023, nous serons confrontés à de nouvelles variantes préoccupantes", a déclaré Mme Justman. "La question est de savoir si nous reviendrons à un point où nous aurons une variante préoccupante qui provoquera une maladie si grave que nous ne pourrons plus bénéficier de la protection offerte par les infections et les vaccinations antérieures. ... Je vais être optimiste et dire que je ne pense pas que nous reviendrons à ce point".
Arlette Saenz et Nikki Carvajal de CNN ont contribué à ce reportage.
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Source: edition.cnn.com