XBB.1.5, BA.2.86, JN.1: Как понять алфавитный суп Covid-19
XBB.1.5, BA.2.86, JN.1: Как понять алфавитный суп Covid-19
Омикрон и Дельта – это названия коронавируса, которые люди быстро выучили и использовали в разгар пандемии. Но на данный момент большинство людей, не являющихся учеными, вероятно, не смогли бы назвать версию вируса, которая станет следующей доминирующей в мире. (Между прочим, это JN.1).
Хотя обычная простуда не так часто получает названия – по крайней мере, те, которые попадают в заголовки газет, – та конкретика, с которой ученые говорят о SARS-CoV‑2, вирусе, вызывающем Covid-19, имеет значение, потому что он все еще представляет собой такую проблему.
У вируса, подобного этому, много разных названий, потому что он постоянно меняется, и ученым нужен общий язык, чтобы говорить о конкретной версии, которую они наблюдают в определенном сообществе или с которой они работают над созданием лечения, вакцин и тестов.
«Боб-вирус» или «Сьюзан-вариант», вероятно, будет легче запомнить, чем BA.2.86, предок JN.1. Но люди, принимающие решения о том, как называть инфекционные заболевания и вирусы, хотели отойти от старой традиции называть вирус по имени животного, у которого он был впервые секвенирован, как в случае с вирусом, ранее известным как оспа обезьян, или по месту, где он был обнаружен, как в случае с геморрагической лихорадкой под названием вирус Марбург, названной в честь западногерманского города Марбург-ан-дер-Лан.
В 2015 году Всемирная организация здравоохранения решила, что присвоение новому инфекционному заболеванию человека имени человека, места или предмета может стать стигмой и привести к непредвиденным негативным последствиям. Например, когда в сезон гриппа 2009-10 годов вирус H1N1, заражающий свиней, птиц и людей, был назван «свиным гриппом», продажи свинины в США снизились, а в таких странах, как Египет, без необходимости были убиты сотни тысяч свиней, хотя вирус не распространялся через употребление свинины.
Вирус, вызывающий Ковид-19, начинался как коронавирус Ухань, поскольку заболевание впервые было выявлено в Ухане, Китай, в феврале 2020 года. Международный комитет по таксономии вирусов назвал его SARS-CoV‑2, сокращение от «коронавирус тяжелого острого респираторного синдрома 2». Команда выбрала такое название, потому что, хотя новый вирус отличается от других, он генетически связан с коронавирусом, который вызвал вспышку атипичной пневмонии в 2003 году.
ВОЗ хотела называть его «вирусом, ответственным за Covid-19», поскольку в то время заявила, что использование названия SARS «может привести к непредвиденным последствиям» и вызвать «ненужный страх у некоторых групп населения, особенно в Азии, которая больше всего пострадала от вспышки SARS в 2003 году». ВОЗ назвала болезнь, вызываемую вирусом Covid-19, что сокращенно означает «коронавирусная болезнь 2019 года», в год, когда она была впервые обнаружена.
Но поскольку ученые должны с точностью говорить о потомстве вируса и поскольку вирусы быстро меняются, по крайней мере на человеческом временном отрезке, названий может быть гораздо больше.
В марте 2020 года ученые, занимавшиеся секвенированием генома вируса, чтобы выяснить, как он эволюционирует, называли одни и те же вариации разными именами в зависимости от лаборатории. Исследователи решили придумать, как сделать так, чтобы все использовали одни и те же названия, и разработали систему наименований под названием Pango или Pangolin, что расшифровывается как филогенетическое присвоение названия глобальной линии вспышки.
«Эта система Pangolin была разработана в 2020 году, когда стало ясно, что Covid станет глобальной проблемой, – говорит доктор Курт Уильямсон, доцент кафедры биологии в Колледже Уильяма и Мэри.
Вирусы меняются так быстро отчасти потому, что в процессе их размножения участвует так называемая РНК-полимераза. Чтобы создать копию клетки, человеческий организм использует ДНК-полимеразу, которая, по словам Уильямсона, обладает очень хорошей функцией корректуры, позволяющей проверять и исправлять ошибки. РНК-полимераза не обладает такой способностью к коррекции, поэтому она делает ошибки гораздо чаще и создает гораздо большие вариации быстрее по сравнению с человеческими временными рамками.
Другой способ изменения вирусов связан с линиями – группами близкородственных вирусов с общим предком. Когда две линии одновременно заражают одну клетку, РНК-полимераза может выполнять так называемое «переключение шаблона», копируя один вирусный геном для создания нового вируса.
«По сути, она может переключаться между использованием одного вируса для создания копии и затем переключиться на геном другой версии вируса, чтобы закончить создание копии, что очень странно, но это приводит к так называемым рекомбинациям», – говорит Уильямсон. По сути, вы взяли черты двух разных вирусов и объединили их в одно потомство, которое может, копируя свой геном, создавать копии с помощью новой комбинации». Это создает проблемы с отслеживанием всех различных версий».
В начале пандемии существовало только две основные линии SARS-CoV‑2: A и B. Когда эти линии мутировали, Панго назвал каждую сублинией – термин, используемый для определения линии, поскольку она является прямым потомком родительской линии. Например, B.1.1.7 – это седьмой вариант подварианта B.1.1, который был первым подвариантом B.1.
В конце концов появились C и D, и так далее, поскольку вирус продолжает создавать новые варианты за счет дрейфовых мутаций, ошибки при копировании и рекомбинации путем переключения шаблонов.
«Поэтому, чтобы ученые могли разговаривать друг с другом, мы используем этот совершенно несерьезный, но точный способ говорить об этом. Какой вариант из какой линии? Он из линии А? Это линия B? Это линия C? И так далее. А когда у вас есть X, например XBB.1.5, X означает, что это рекомбинант», – сказал Уильямсон.
«Это неудобно», – добавил он. «Но он попадает в публичные сообщения».
Это что-то вроде «Кто на первом месте? Что на втором?» может иметь смысл для ученых, которые должны знать о каждом изменении, но для широкой публики это быстро стало слишком сложным, поэтому некоторые люди стали использовать более привычные термины, например «кентский вариант» для B.1.1.7, который был назван так по месту его секвенирования.
В мае 2021 года, чтобы избавиться от стигмы, связанной с присвоением смертельному вирусу названия места, и уйти от «неуклюжести», ВОЗ придумала более простую систему греческих букв для названия некоторых вариантов. Она не заменила Pango или другие научные системы наименований, необходимые для более конкретного общения между учеными, но стала использовать эти новые обозначения только для вариантов, которые значительно отличались от оригинала и представляли другую угрозу для здоровья населения – то, что агентство называло вариантами, представляющими интерес, или вариантами, вызывающими беспокойство. Вариант «Кент», или B.1.1.7, был переименован в «Альфа». B.1.617.2, впервые выявленный в Индии, стал Дельтой, и так далее.
ВОЗ необходимо было провести различие между штаммом Delta и штаммом Omicron, потому что различия в вирусе были настолько значительными, что влияли на его поведение, а наши иммунные системы едва распознавали новую версию вируса, что приводило к новым волнам инфекций, госпитализаций и смертей.
В то время существовал и второй штамм Omicron, BA.2, с десятками новых генных мутаций, который, по мнению некоторых, заслуживал собственной греческой буквы. Но этого так и не произошло. Вместо этого ВОЗ создала новую категорию субвариантов Omicron, за которыми ведется наблюдение, чтобы люди, занимающиеся вопросами общественного здравоохранения, знали, за какими из побочных эффектов следует следить.
Ученые также используют другие системы классификации, чтобы описать сходства и различия между вирусами, которые они изучают.
Получайте еженедельную рассылку CNN Health
Подпишитесь здесь, чтобы каждыйвторник получать рассылкуThe Results Are In with Dr. Sanjay Guptaeот команды CNN Health.
Существует также Nextclade- инструмент, используемый для классификации последовательностей вирусов в зависимости от их генетического родства. Не каждая версия вируса попадает в свой собственный клад, но члены клада будут иметь схожие черты из-за общего происхождения. В этой системе используется двузначный год, за которым следует буква, указанная в порядке присвоения этого года, так что, например, 22A – это первый кладе в 2022 году.
«Несмотря на то, что для широкой публики эта система звучит несколько неуклюже, она позволяет ученым точно знать, о чем говорит другой человек, когда они используют эту систему для общения, и это очень важно, – говорит Уильямсон.
Но, по его словам, существует так много различий, что продолжается дискуссия о создании новых правил для упрощения именования. Возможно, систему названий придется изменить просто потому, что вариантов так много, что они потребуют слишком много букв, что сделает их запоминание слишком сложным даже для ученых.
Хотя, по словам Уильямсона, широкой общественности не стоит беспокоиться о таком уровне специфичности Ковида, люди могут внести свой вклад в облегчение ситуации, уменьшив распространение коронавируса и количество новых вариантов.
Наряду с вакцинацией Covid-19, «люди могут делать такие простые вещи, как мытье рук, надевание маски на людей из группы риска или, если вы плохо себя чувствуете, оставайтесь дома. Это довольно простые вещи, которые мы все в состоянии сделать», – сказал он.
Читайте также:
- Неограниченные забастовки немецких поездов
- Что ждет немецкий рынок труда в 2024 году
- Фермеры протестуют в Берлине на сотнях тракторов
Источник: edition.cnn.com
Читайте также:
Обсуждение
Самые последние новости
