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XBB.1.5, BA.2.86, JN.1: How to make sense of the alphabet soup of Covid-19

The virus that causes Covid-19 can be described in more letters than a bowl of alphabet soup for its many descendants.

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XBB.1.5, BA.2.86, JN.1: How to make sense of the alphabet soup of Covid-19

Omicron und Delta sind Namen für das Coronavirus, die die Menschen auf dem Höhepunkt der Pandemie schnell gelernt und verwendet haben. Aber im Moment können die meisten Nicht-Wissenschaftler wahrscheinlich nicht die Version des Virus benennen, die zum nächsten weltweit dominierenden Virus werden wird. (Das ist übrigens JN.1.)

Obwohl die Erkältung nicht so viele Namen hat – zumindest keine, die Schlagzeilen machen – ist es für Wissenschaftler wichtig, über die Besonderheiten von SARS-CoV-2, dem Virus, das Covid-19 verursacht, zu sprechen, weil es immer noch ein so großes Problem darstellt Problem .

Ein Virus wie dieser hat viele verschiedene Namen, weil er sich ständig verändert und Wissenschaftler eine gemeinsame Sprache brauchen, um darüber zu sprechen, was sie in bestimmten Gemeinschaften sehen oder welche spezifischen Versionen von Behandlungen, Impfstoffen und Tests sie entwickeln.

„Viral Bob“ oder „Mutation Susan“ ist wahrscheinlich leichter zu merken als der Vorfahre von JN.1, BA.2.86. Aber diejenigen, die über die Benennung von Infektionskrankheiten und Viren entscheiden, möchten sich von einer jahrhundertealten Tradition lösen, Viren nach dem Tier zu benennen, bei dem sie erstmals sequenziert wurden, wie bei dem Virus, das früher als Affenpocken bekannt war, oder nach dem Ort, an dem es entdeckt wurde. , wie das als Marburg-Virus bekannte hämorrhagische Fieber, benannt nach der westdeutschen Stadt Marburg an der Land.

Im Jahr 2015 entschied die Weltgesundheitsorganisation, dass die Benennung einer neuen menschlichen Infektionskrankheit nach einer Person, einem Ort oder einer Sache stigmatisierend sein und unbeabsichtigte negative Folgen haben könnte. Während der Grippesaison 2009/10 beispielsweise, als das H1N1-Virus, das Schweine, Vögel und Menschen infiziert, als „Schweinegrippe“ bezeichnet wurde, gingen die Schweinefleischverkäufe in den USA zurück und Hunderttausende Schweine wurden in Ländern wie Ägypten getötet unnötig, auch wenn das Virus nicht durch den Verzehr von Schweinefleisch verbreitet wird.

Das Virus, das Covid-19 verursacht, war ursprünglich das Wuhan-Coronavirus, da die Krankheit erstmals im Februar 2020 in Wuhan, China, entdeckt wurde. Das Internationale Komitee zur Taxonomie von Viren nennt es SARS-CoV-2, kurz für „Coronavirus 2 mit schwerem akutem respiratorischem Syndrom“. Das Team wählte den Namen, weil das neue Virus zwar anders ist, aber genetisch mit dem Coronavirus verwandt ist, das 2003 den SARS-Ausbruch verursachte.

Die WHO wollte es „das Virus, das Covid-19 verursacht“ nennen, weil damals gesagt wurde, dass die Verwendung des Namens SARS „unbeabsichtigte Folgen haben“ und „in manchen Bevölkerungsgruppen, insbesondere bei asiatischen Menschen, unnötige Angst hervorrufen“ könne .“ Im Jahr 2003 hatte die SARS-Epidemie die schwerwiegendsten Auswirkungen auf unser Land. Die WHO nannte die durch das Virus verursachte Krankheit Covid-19, kurz für „Coronavirus Disease 2019“, das Jahr, in dem das Virus erstmals entdeckt wurde.

Da Wissenschaftler jedoch speziell über die Nachkommen des Virus sprechen müssen und sich Viren schnell verändern (zumindest innerhalb menschlicher Zeitskalen), sind wahrscheinlich noch viel mehr Namen im Spiel.

Im März 2020 gaben Wissenschaftler, die das Genom des Virus sequenzierten, um zu verstehen, wie es sich entwickelte, denselben Mutationen je nach Labor unterschiedliche Namen. Die Forscher beschlossen, eine Möglichkeit zu finden, allen den gleichen Namen zu geben, und entwickelten daher ein Benennungssystem namens Pango oder Pangolin, das die phylogenetische Zuordnung benannter globaler Ausbruchslinien darstellt.

„Das Pangolin-System wurde im Jahr 2020 entwickelt, als klar war, dass COVID-19 ein globales Problem sein würde“, sagte Dr. Pangolin. Kurt Williamson, außerordentlicher Professor in der Abteilung für Biologie am College of William and Mary.

Ein Grund dafür, dass sich Viren so schnell verändern, ist, dass bei ihrer Vermehrung ein Enzym namens RNA-Polymerase beteiligt ist. Um Zellen zu kopieren, verwendet der Körper DNA-Polymerase, die laut Williamson sehr gute Korrekturlesefähigkeiten besitzt und Fehler überprüfen und reparieren kann. Die RNA-Polymerase verfügt nicht über diese Korrekturlesefähigkeit, daher macht sie häufiger Fehler und erzeugt im Vergleich zum menschlichen Zeitrahmen schneller größere Mutationen.

Eine andere Art und Weise, wie sich Viren verändern, sind Abstammungslinien, eine Gruppe eng verwandter Viren, die einen gemeinsamen Vorfahren haben. Wenn zwei Abstammungslinien gleichzeitig eine Zelle infizieren, kann die RNA-Polymerase einen Vorgang namens „Template Switching“ durchführen und dabei ein virales Genom kopieren, um ein neues Virus zu erzeugen.

„Es wird grundsätzlich zwischen der Verwendung eines Virus zur Replikation und dem Wechsel zu einer anderen viralen Version des Genoms zur Vervollständigung der Replikation gewechselt, was wirklich seltsam ist, aber es führt zu einer sogenannten Rekombination“, sagte Williamson. Sie haben im Wesentlichen die Eigenschaften von zwei übernommen verschiedene Viren und kombinierte sie zu einem einzigen Nachkommen, und wenn es sein Genom repliziert, repliziert es sich mit dieser neuen Kombination. „Dies führt zu Problemen bei der Verfolgung aller verschiedenen Versionen.“ "

Zu Beginn der Pandemie gab es nur zwei Hauptlinien von SARS-CoV-2: A und B. Als diese Abstammungslinien mutierten, benannte Pango jede Unterlinie, ein Begriff, der zur Definition einer Abstammungslinie verwendet wird, da sie ein direkter Nachkomme einer elterlichen Abstammungslinie ist. Beispielsweise ist B.1.1.7 die siebte Variante von B.1. 1 Untervariante, die die erste Untervariante von B.1 ist.

Als das Virus schließlich durch Driftmutationen, Fehler bei der Replikation und Rekombination durch Template-Wechsel weiterhin neue Varianten erzeugte, entstanden unter anderem C und D.

„Um Wissenschaftler dazu zu bringen, miteinander ins Gespräch zu kommen, haben wir uns für diese unsexy, aber präzise Art und Weise entschieden, darüber zu sprechen: Welche Variante stammt aus welcher Abstammungslinie? Ist es die A-Abstammungslinie? Ist es die B-Abstammungslinie? Ist es die C-Abstammungslinie?“ Und so weiter. Und wenn Sie dann XBB.1.5 wie X haben, bedeutet X, dass es neu kombiniert wird“, sagte Williamson.

„Es ist sperrig“, fügte er hinzu. „Aber es gelangt in die öffentliche Kommunikation.“

Für Wissenschaftler, die jede noch so kleine Änderung verstehen müssen, mag das „Wer ist zuerst dran? Was kommt als Zweites?“-Ordnung bei der Benennung sinnvoll sein, aber für die breite Öffentlichkeit wird es schnell zu viel. Es ist kompliziert, daher fangen manche Leute an, etwas mehr zu verwenden bekannte Begriffe wie „Kent-Variante“ für B.1.1.7, benannt nach seiner sequenziellen Position. Mai 2021 Um das Stigma der Benennung tödlicher Viren nach Standorten zu beseitigen und die „Klobigkeit“ zu beseitigen, hat die WHO ein einfacheres griechisches Alphabetsystem für die Benennung einiger dieser Varianten vorgeschlagen. Es ersetzt weder Pango noch ein anderes wissenschaftliches Benennungssystem, das für eine spezifischere Kommunikation zwischen Wissenschaftlern erforderlich ist, sondern verwendet diese neuen Namen nur für Varianten, die sich erheblich von der Originalversion unterscheiden und eine andere Art von Bedrohung für die öffentliche Gesundheit darstellen – worauf sich die Behörden beziehen als Varianten von Interesse oder Varianten von Besorgnis zu bezeichnen.„Kent-Variante“ oder B.1.1.7, wurde in Alpha umbenannt. B.1.617.2, zuerst in Indien identifiziert, später zu Delta usw.

Die WHO muss zwischen dem Delta-Stamm und dem Omicron-Stamm unterscheiden, weil das Virus so anders ist, dass es sein Verhalten beeinflusst und unser Immunsystem die neue Version des Virus kaum erkennen kann, was zu einem neuen Stamm führt. Infektionswellen , Krankenhausaufenthalte und Todesfälle. Die WHO muss in der Lage sein, über diese Unterschiede zu sprechen.

Zu dieser Zeit gab es einen zweiten Omicron-Stamm, BA.2, mit Dutzenden neuer genetischer Mutationen, die einige für würdig hielten, eigene griechische Buchstaben zu tragen. Aber das ist nie passiert. Stattdessen hat die WHO eine neue Kategorie von Omicron-Subvarianten erstellt und diese überwacht, um das Gesundheitspersonal darüber zu informieren, über welche Derivate sie sich Sorgen machen sollten.

Wissenschaftler verwenden auch andere Klassifizierungssysteme, um die Ähnlichkeiten und Unterschiede zwischen den von ihnen untersuchten Viren zu beschreiben.

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Es gibt auch Nextclade, ein Tool zur Klassifizierung viraler Sequenzen anhand ihrer genetischen Verwandtschaft. Nicht jede Version des Virus wird eine eigene Gruppe haben, aber Mitglieder der Gruppe werden aufgrund eines gemeinsamen Vorfahren ähnliche Merkmale aufweisen. Das System verwendet eine zweistellige Jahreszahl, gefolgt von einem Buchstaben, der in der Reihenfolge der Zuteilung für dieses Jahr angegeben ist, sodass 22A der erste Zweig des Jahres 2022 ist.

„Obwohl unser System für die Öffentlichkeit etwas klobig klingen mag, ermöglicht es Wissenschaftlern, genau zu wissen, was die andere Person sagt, wenn sie damit kommuniziert, was wichtig ist“, sagte Williamson.

Doch die Unterschiede seien so groß, dass weiterhin über die Einführung neuer Regeln zur Vereinfachung der Namensgebung diskutiert werde, sagte er. Möglicherweise muss sich auch das Benennungssystem ändern, da es so viele Varianten gibt, die zu viele Buchstaben erfordern, wodurch die Dinge zu komplex werden, als dass sich selbst Wissenschaftler daran erinnern könnten.

Williamson sagte, dass sich die Öffentlichkeit zwar keine Sorgen über die Spezifität des Coronavirus machen sollte, sie aber ihren Teil dazu beitragen könne, die Dinge einfacher zu machen, indem sie die Ausbreitung des Coronavirus und die Anzahl neuer Varianten reduziere.

Zusätzlich zur Impfung gegen Covid-19 „können die Menschen einfache Dinge tun, wie sich die Hände waschen, in der Nähe von Personen mit hohem Risiko eine Maske tragen oder zu Hause bleiben, wenn man sich nicht wohl fühlt.“ Diese sind sehr niedrig „Dinge, zu denen wir alle fähig sind“, sagte er.

SAN FRANCISCO, CA – 27. OKTOBER: Am 27. Oktober 2022 ist in San Francisco, Kalifornien, ein Büro frei. Laut einem Bericht des Gewerbeimmobilienunternehmens CBRE verfügt San Francisco über eine rekordverdächtige Bürofläche von 27,1 Millionen Quadratmetern, während die Stadt daran arbeitet, sich von der Covid-19-Pandemie zu erholen. Das U.S. Census Bureau berichtet, dass schätzungsweise 35 % der Arbeitnehmer in San Francisco und San Jose weiterhin von zu Hause aus arbeiten. (Foto von Justin Sullivan/Getty Images)

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While the common cold does not have as many names as Covid-19, it is important for scientists to discuss the unique characteristics of SARS-CoV-2, the virus that causes Covid-19, as it continues to be a significant problem.

Due to the constant mutations of the virus, it has many different names, as scientists need a common language to discuss what they see in specific communities or develop specific versions of treatments, vaccines, and tests. The virus that causes Covid-19 had several names, including the Wuhan-Coronavirus and SARS-CoV-2, before it was officially named Covid-19 by the World Health Organization (WHO).

The WHO decided that using the name SARS could have unintended consequences, such as causing unnecessary fear in certain population groups, especially Asian people. Therefore, they chose to name the disease caused by the virus Covid-19, which was first identified in the year 2019. However, as the virus evolves and mutates, scientists continue to develop new names for its variants.

To address this complexity, scientists developed a naming system called Pango or Pangolin, which assigns a common name to all versions of the virus, regardless of where it was first identified or the name given to it by different laboratories. This naming system allows scientists to easily communicate about specific variants of the virus and develop strategies to combat them. So even if a variant like XBB.1.5 is introduced, scientists will be able to quickly identify its origins and develop appropriate responses.

Source: edition.cnn.com

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