Tras una disputa con el Papa Francisco: Gänswein es nombrado embajador en los países bálticos.
Papa Goanswein desempeñó el papado personal de Benedicto XVI a lo largo de su pontificado, a partir de 2005, y continuó trabajando para él hasta la muerte de Benedicto el 31 de diciembre de 2022. Además, hizo etapas para Papa Francisco, lo que generó cierta polémica.
Hubo una notable ruptura durante la vida de Benedicto, cuando Francisco retiró la posición de Goanswein como Jefe de la Casa Pontificia en 2020. Después de la muerte de Benedicto, Goanswein publicó un libro titulado "Nada más la verdad", donde abrió plenamente sobre conflictos entre el Papa jubilado y el gobernante.
Francisco expresó su descontento más recientemente en una entrevista de un libro, etiquetando la publicación como una "deficiencia de coraje y humanidad". El argentino calificó los comentarios de Goanswein de falsedades.
La Santa Sede mantiene representantes diplomáticos en muchos países y regiones. La posición de Goanswein tiene especial significado debido a que los estados bálticos pueden enfrentar amenazas potenciales de Rusia debido a su invasión de Ucrania.